病因相当复杂。本病可能与免疫紊乱有关。部分糖尿病、甲状腺机能亢进、斑秃等免疫疾病患者伴发白癜风也支持本病和自身免疫有关。也有人发现患者的微量元素，如铜、锌、铁等含量常常偏低，故认为可能是微量元素降低或生物酶代谢异常所致。此外，有些白癜风发生于接触某些化学物质以后，被认为和某些化学因子有关。有些患者则是在精神受到刺激后发生白癜风。还有部分人有明显的遗传家族史，被认为和某些与免疫有关的基因相关。另外还有些在冻疮、湿疹、皮炎或牛皮癣等炎症性疾病消退时出现白癜风，称继发性白癜风。